오라클이 옥스퍼드 대학교와 협력해 글로벌 병원체 분석 시스템(Global Pathogen Analysis System, 이하 GPAS)을 구축하고, 전 세계 기업 및 의료 조직이 변이 코로나 바이러스를 보다 신속하게 식별하고 필요한 조치를 취할 수 있도록 지원한다.
오라클 클라우드 인프라스트럭처(Oracle Cloud Infrastructure, 이하 OCI)와 옥스포드의 확장 가능한 병원체 파이프라인 플랫폼(Scalable Pathogen Pipeline Platform, 이하 SP3)을 결합해 개발된 GPAS는 기업 및 의료 조직이 전 세계적인 코로나바이러스감염증-19(이하 코로나19) 회복 속도를 늦추고, 높은 전염력과 잠재적으로 백신 면역을 저해할 가능성이 있는 변이 코로나 바이러스에 효과적으로 대응하는 것을 목표로 한다. 해당 이니셔티브는 영국 웰컴 트러스트(Wellcome Trust)의 자금 지원을 받고 있는, 웨일즈 공중 보건국(Public Health Wales), 카디프 대학교(University of Cardiff), 영국 보건국(Public Health England)이 속한 컨소시엄의 연구를 바탕으로 개발되었다.
결핵 연구에 최초로 사용되었던 SP3는 이제 SARS-CoV-2 의 서열 데이터를 통합, 표준화, 분석 및 비교함으로써 해석된 게놈 서열을 생성하고, 새로운 변이체 및 관련 대상을 식별하는 용도로 쓰이고 있다. 오라클의 광범위한 신규 개발 작업을 바탕으로 데이터 처리 역량이 개선된 것은 물론, 우수한 성능과 보안을 갖춘 SP3는 이제 오라클 클라우드를 통해 전 세계 어디서나 언제든지 활용 가능하다. SP3 시스템은 글로벌 규모로 데이터를 취합한 후 수 분 이내로 코로나19 분석에 대한 포괄적이고 표준화된 결과를 도출하며, 이러한 결과는 안전한 환경에서 전 세계 국가와 공유된다.
오라클 클라우드의 광범위한 머신러닝 기능을 활용해 협력에 참가하는 세계 전역의 과학자, 연구원 및 정부 기관은 최초로 대규모의 코로나19 병원체 데이터를 처리 및 분석, 시각화하고 필요한 조치를 취할 수 있게 되었다. 관심 대상 변종(variants of interest) 식별과 이에 따른 백신 및 치료 효과에 대한 잠재적 영향을 파악하는 것도 가능하다. 예를 들어, 시스템의 분석 대시보드를 통해 특정 균주가 다른 균주보다 더 빨리 확산하는지, 유전적 특징이 전파율 증가 및 백신 탈출(vaccine escape)에 영향을 미치는지에 대해 확인할 수 있다. 옥스퍼드 대학교는 이미 전 세계 SARS-CoV-2 시퀀스의 절반에 달하는 총 500,000 개 이상의 시퀀스를 처리한 바 있다.
오라클은 향후 해당 서비스 대상을 모든 병원체로 확장하고, 각종 연구 기관과 공공 보건 기관 및 민간 기업의 과학자들과 협력함으로써 관련 연구를 기반으로 전 세계 전염병 대응 전략에 관한 의사 결정에 정보를 제공해나갈 방침이다. 또한, 해당 플랫폼은 전 세계 연구진과 비영리 단체에게 무료로 제공된다.
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